ll CRS4, il Centro di ricerca del Parco tecnologico della Sardegna
(Pula, Cagliari), scende in campo per l’emergenza da SARS-CoV-2 - la
sindrome respiratoria acuta grave coronavirus 2 - mettendo a
disposizione della comunità scientifica la piattaforma di
sequenziamento genomico, di bioinformatica e di analisi dati,
denominata Next.
Il Centro è attivo da 30 anni nell’attività di ricerca su tecnologie
digitali abilitanti, tra queste le bioscienze. Next sarà a
disposizione dei ricercatori di tutto il mondo che ne faranno
richiesta, tramite accesso da remoto, per effettuare esperimenti utili
a studiare e a sviluppare nuove metodologie diagnostiche, nuove
terapie, effettuare studi di sequenza per supportare lo sviluppo di
vaccini, individuare i migliori trattamenti per la cura della
malattia, supportare il monitoraggio epidemiologico utile per modulare
l’impatto degli interventi di salute pubblica, utilizzando tecnologie
di sequenziamento massivo su campioni di acidi nucleici non patogeni.
I ricercatori del CRS4 saranno a disposizione per verificare se
esistono opportunità nell’utilizzo delle tecnologie di sequenziamento
massivo, per definire il disegno degli esperimenti e per individuare
le migliori modalità di uso delle macchine, effettuando direttamente
gli esperimenti di sequenziamento presso il laboratorio di Pula,
certificato Illumina.
Per ulteriori informazioni: http://next.crs4.it oppure covid19-next@crs4.it
La piattaforma Next
Il CRS4, centro di ricerca interdisciplinare, sviluppa e applica
soluzioni innovative in vari settori. Nell’area biomedica in
particolare, ha sviluppato procedure sperimentali e informatiche in
grado di gestire il flusso di dati generati dalla nuova generazione di
sequenziatori e di estrarre dati significativi dall’analisi combinata
di tutto il genoma, esoma e trascrittoma. La piattaforma di
sequenziamento NEXT è tra i più grandi centri di sequenziamento in
Italia e da anni il CRS4 funge da guida nel contesto nazionale
sull’applicazione del Next Generation Sequencing (NGS) a studi di
grande e grandissima scala. Le strumentazioni della piattaforma di
sequenziamento massivo gestita dal Centro includono attualmente 1
Illumina Hiseq 3000, 3 Illumina HiSeq 2000/HiSeq2500 ed un
sequenziatore Illumina MiSeq. L’infrastruttura del CRS4, basata su una
combinazione unica di ricerca e sviluppo, di tecnologie sperimentali e
risorse computazionali, integra le risorse di calcolo e di data
storage (stoccaggio data) del Centro con la strumentazione presente
nella piattaforma di sequenziamento e consente l’accesso alla comunità
estesa dei ricercatori e degli operatori del settore sanitario, a
competenze multidisciplinari e capacità computazionali dedicate
specificamente alla ricerca biomedicale.